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CEBIMário sobre evo-devo de briozoários

Nesta quinta-feira, 27 de agosto de 2020 às 13:30 (horário de Brasília) darei uma palestra online no ciclo de seminários do Centro de Biologia Marinha da Universidade de São Paulo também conhecido como CEBIMários.

Poster CEBIMário
Link de acesso: https://meet.google.com/vht-uoij-ohv

Vou falar sobre como embriões evoluem baseado no meu trabalho com evo-devo de briozoários e clivagem espiral!

Edit: a palestra foi gravada e está no YouTube:

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O blastóporo dos embriões de briozoários

Este é um embrião de briozoário mostrando seu blastóporo. Estes animais são discretos porém quase onipresentes nos mares e lagos do mundo todo.

Embrião de briozoário durante gastrulação mostrando seu blastóporo.
Embrião do briozoário Membranipora membranacea sob microscopia confocal.

O que vemos é o DNA dentro do núcleo das células desse embrião. O degradê de cores indica se os núcleos estão mais perto (amarelo) ou mais longe (roxo) da câmera do microscópio.

As células embrionárias se arranjam em círculo e formam uma abertura na parte central que chamamos de blastóporo. Esta abertura, nos briozoários, vai se tornar a boca do animal quando o embrião crescer.

Você pode acompanhar o processo em vídeo ou conhecer mais detalhes no artigo.

E a nossa boca, vem de onde?

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Converter vídeo para GIF animado

Algo que comecei a fazer com mais freqüência é converter vídeos de embriões se desenvolvendo ou de animais marinhos para GIFs animados. Mas como fazer a conversão sem perder a qualidade?

Uma medusa mexendo seus tentáculos. Fonte: Cifonauta.

Bastante tempo atrás encontrei este guia para converter vídeos em GIFs animados de alta qualidade usando a ferramenta FFmpeg. O truque é gerar uma paleta de cores a partir do próprio vídeo para melhorar a qualidade das cores do GIF. Baseado no guia, criei um pequeno bash script para facilitar a minha vida e talvez a sua ;)

Acesse em https://github.com/nelas/gif.sh

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Larva de um braquiópode

Larva de um braquiópode Terebratalia transversa sob microscopia confocal.
Terebratalia transversa (Sowerby, 1846)
Óleo sobre tela
167.95 µm × 167.95 µm
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Embrião de mosca-das-frutas sob SPIM

Um curto vídeo que fiz com o desenvolvimento embrionário da simpática drosófila, também conhecida como mosquinha da banana, ganhou menção honrosa no concurso de vídeos Small World in Motion.

Um único embrião filmado por quatro ângulos diferentes.

A descrição completa das técnicas e o vídeo em qualidade original estão disponíveis pra baixar e re-usar na Wikimedia Commons.

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Entendendo a evolução de padrões de clivagem no desenvolvimento embrionário

Video resumo sobre nosso trabalho sobre desenvolvimento de briozoários e evolução de padrões de clivagem embrionária publicado na BMC Biology!

O vídeo foi produzido pela Research Square. Também disponível no Vimeo.
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Embriões de briozoários vistos do pólo animal e vegetal

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Embriões de briozoários vistos do pólo animal

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Verme nemertíneo jovem aprendendo a caçar

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Jovens nemertíneos